โรคสําคัญที่เกิดจากหนู มีดังนี้
กาฬโรค
กาฬโรคนั้นเป็นโรคติดต่อที่แพร่ระบาดในหนู และในสัตว์ฟันแทะอื่น ๆ ที่น่ากลัวก็คือ มันสามารถติดต่อมาถึงคนได้ โรคนี้มีหมัดหนูที่อาศัยบนตัวหนูเป็นพาหะ กาฬโรคติดต่อมายังคนได้หลายช่องทาง เช่น ถูกหมัดหนูกัด สัมผัสสัตว์ที่ป่วยหรือตายด้วยโรคนี้ สัมผัสกับสารคัดหลั่งจากทางเดินหายใจของผู้ป่วยโรคนี้ เป็นต้น
โรคเลปโทสไปโรซิส
โรคเลปโทสไปโรซิส หรือ “โรคฉี่หนู” โรคนี้เป็นโรคที่แพร่ระบาดในฤดูฝนในบริเวณที่มีน้ำท่วมขัง เกิดจากแบคทีเรีย ชื่อเลปโทสไปรา (Lepto spira interrogans) ซึ่งการติดโรคจะเกิดจากการสัมผัสฉี่ของสัตว์ต่าง ๆ อาการของโรคฉี่หนูนั้นจะมีอาการไข้คล้ายไข้หวัดใหญ่ ปวดเมื่อยตามตัวและที่สำคัญคือ จะมีอาการปวดกล้ามเนื้อมัดใหญ่ เช่น ขา น่อง นอกจากนี้แล้วจะมีอาการปวดศีรษะ
โรคฮันทาไวรัส
ฮันทาไวรัส เป็นโรคที่พบได้จากหนูตามท้องนาและหนูบ้าน โดยเชื้อไวรัสจะปะปนอยู่ในปัสสาวะ อุจจาระและน้ำลายของหนู ผู้ที่ติดสามารถเชื้อได้จากการสัมผัสโดยตรงหรือสูดเอาละอองจากสิ่งขับถ่ายของหนูเข้าไป อาการของผู้ป่วยเป็นโรคนี้ จะมีไข้สูงเฉียบพลัน ปวด ศีรษะ อ่อนเพลีย เบื่ออาหาร คลื่นไส้ อาเจียน ปวดท้องหรือปวดเอวมาก ตาแดง มีจุดเลือดออก ปัสสาวะน้อย ตัวเย็น ความดันเลือดต่ำ ช็อก โอกาสเสียชีวิตค่อนข้างสูง เป็นโรคนี้ในประเทศไทยยังไม่มากนัก แต่ก็ต้องคอยระวังเนื่องจากโรคอาจมากับชาวต่างชาติ ที่เดินทางเข้ามาในประเทศไทยได้
โรคซัลโมเนลโลซิส (Salmonellosis)
โรคนี้เป็นโรคที่เกี่ยวกับทางเดินอาหาร แต่ก็เกี่ยวข้องกับหนูในฐานะที่หนูเป็นรังโรค โรคซัลโมเนลโลซิส เกิดจากแบคทีเรียซัลโมเนลลาหลายสายพันธุ์ เป็นการติดเชื้อเฉียบพลันในลำไส้ แหล่งรังโรคอันสำคัญอื่น ๆ นอกเหนือจากหนูคือ เป็ด ไก่ และสัตว์เลี้ยง
ไข้หนูกัด (Rat bite fevers)
ถ้าเราถูกหนูกัด เราอาจจะแค่เป็นแผลธรรมดา แต่ถ้าโชคร้ายกว่านั้น หนูที่เรากัดมีเชื้อโรคอยู่ในร่างกาย เราก็อาจจะได้รับเชื้อโรคร้ายจากหนูเป็นของแถมก็ได้ เช่น โรคพิษสุนัขบ้า หรือเราอาจจะเป็นโรคไข้หนูกัด ซึ่งเกิดจากแบคทีเรียที่อยู่ในตัวหนูที่ชื่อ Spirillum minus อาการของโรคนี้จะเริ่มต้นจากเป็นไข้หนาวสั่นทันทีทันใด ปวดหัว ปวดกล้ามเนื้อ มีผื่นขึ้นตามผิวหนัง บางคนมีจุดเลือดออกหรือตุ่มหนอง ข้อบวมแดงและปวด ถ้าปล่อยทิ้งไว้ก็อาจเป็นอันตรายถึงชีวิตได้
โรคสครับไทฟัส
สครับไทฟัส เป็นโรคที่เกิดจากแบคทีเรียจำพวกริกเกตต์เซียมีไรเป็นพาหะนำโรค ไรเหล่านี้อาศัยบนตัวสัตว์ฟันแทะ เช่น หนู กระแต กระต่าย เป็นต้น เป็นโรคที่สามารถติดต่อจากสัตว์สู่คนได้ ซึ่งอาจจะเกิดโดยบังเอิญ โดยถูกพาหะนำโรคที่มีเชื้อกัด อาการที่สำคัญของโรคนี้ ได้แก่ ปวดศีรษะอย่างรุนแรงบริเวณขมับและหน้าผากมีไข้สูง หนาวสั่น เพลีย ปวดเมื่อยตัว อาเจียน ปวดท้อง ท้อง ร่วง ปวดกระบอกตา ไต ตับ ม้ามโต และอาจพบแผลบริเวณที่ถูกไรกัด
โรคมิวรีนไทฟัส
มิวรีนไทฟัส เกิดจากเชื้อริกเกตต์เซียที่ชื่อ Rickettsiae typhi โดยที่เชื้อชนิดนี้อยู่ในตัวหมัด เมื่อหมัดหนูกัดคนก็จะถ่ายมูลออกมา เชื้อจะเข้าสู่บาดแผลที่ถูกกัด ผู้ป่วยจะมีไข้สูง ปวดศีรษะมาก ปวดเมื่อย และมีผื่น อาการของโรคจะรุนแรงน้อยกว่าสครับไทฟัส
โรคพยาธิตัวตืด
พยาธิตัวตืดจะอาศัยอยู่ในลำไส้ของหนู โดยไข่พยาธิจะปะปนออกมากับอุจจาระ เมื่อหมัดหนูหรือแมลงปีกแข็งกินไข่พยาธิเข้าไป ตัวอ่อนจะเจริญอยู่ในตัวหมัด เมื่อหนูหรือคนกินหมัดเข้าไป ตัวอ่อนก็จะเจริญเป็นตัวเต็มวัยอยู่ในลำไส้ของหนูและคน หากมีพยาธิในร่างกายเราไม่มากก็จะไม่มีอาการอะไร แต่ถ้ามีพยาธิมาก ก็จะมีอาการปวดศีรษะ ปวดท้อง อาเจียน น้ำหนักตัวลด ไม่มีกำลัง มีอาการทางประสาทคล้ายลมบ้าหมู นอนไม่หลับ ไม่มีชีวิตชีวา ไม่รู้สึกหิว คันบริเวณจมูกและทวารหนัก นอกจากนี้อาจพบอาการอุจจาระร่วงและมีเลือดปน ร่วมทำให้เกิดภาวะโลหิตจางได้ รายที่ความต้านทานต่ำจะเกิดอาการแพ้ได้